对于朱辅和徐俌，朱厚照并没有给他们太多的压力，只是要求他们查清缺员、有无吃空饷、克扣粮饷的等情况。对于有问题的武官，必须进行惩处。
轰轰烈烈的清查卫所在南京城开始了。
按照朱厚照的计划，他原本打算将官府冗员问题彻底解决之后，再进行卫所的清查。毕竟卫所作为大明最重要的武装力量，如果一个搞不好，极容易出现哗变，影响十分的大。
但是朱厚照在千秋岭剿匪，以及太湖的遭遇，深深地感受到，没有武装力量的支撑，自己的改革将非常不把握。
如果遇到强敌阻挠的话，会很不好办。
虽然自己贵为太子，但是强龙难压地头蛇。
魏国公徐俌、镇守太监刘云、应天府府尹武雄等人虽然被自己收拾得服服帖帖，但是在江南，那些既得利益集团势力还是非常庞大。
他们不敢在明面上与自己作对，但是暗地里捣乱，也会令你受不了的。
除了这一点，还有就是，在暗处隐藏着一股三番五次想要置自己于死地的神秘势力。
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